Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ITGB6P18564 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms