Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms