Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CTLA4P16410 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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