Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGB4P16144 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms