Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAV1P15498 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VAV1P15498 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms