Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD8P13378 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms