Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEFHP12036 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEFHP12036 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms