Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ITGAMP11215 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms