Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD8BP10966 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD8BP10966 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD8BP10966 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD8BP10966 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms