Protein–RNA interactions for Protein: P0C5Y4

KRTAP1-4, Keratin-associated protein 1-4, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-4P0C5Y4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
KRTAP1-4P0C5Y4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms