Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4BP0C0L5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4BP0C0L5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms