Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPBP07199 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPBP07199 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms