Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGAVP06756 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms