Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PAPLNO95428 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms