Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LRATO95237 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LRATO95237 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRATO95237 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRATO95237 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRATO95237 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms