Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL18O94889 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms