Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCTN3O75935 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1935.5 ms