Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SKAP2O75563 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SKAP2O75563 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms