Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPFIA4O75335 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms