Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIPSNAP2O75323 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms