Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
GMDSO60547 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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