Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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HDAC3O15379 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC3O15379 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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