Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AGRPO00253 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AGRPO00253 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AGRPO00253 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms