Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms