Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A6NL46 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A6NL46 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A6NL46 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms