Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5S2

CDC42BPB, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42BPBQ9Y5S2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42BPBQ9Y5S2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42BPBQ9Y5S2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42BPBQ9Y5S2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42BPBQ9Y5S2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42BPBQ9Y5S2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDC42BPBQ9Y5S2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms