Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNPO3Q9Y5L0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms