Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms