Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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