Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TMED7Q9Y3B3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms