Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC8Q9Y2L5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms