Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SBNO2Q9Y2G9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms