Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DTX4Q9Y2E6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms