Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
L1RE1Q9UN81 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms