Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
FBXL4Q9UKA2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms