Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CGGBP1Q9UFW8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms