Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTNNAL1Q9UBT7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms