Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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CPNE7Q9UBL6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CPNE7Q9UBL6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CPNE7Q9UBL6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CPNE7Q9UBL6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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CPNE7Q9UBL6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CPNE7Q9UBL6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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