Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COPG2Q9UBF2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms