Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LRFN1Q9P244 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LRFN1Q9P244 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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