Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KRT84Q9NSB2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRT84Q9NSB2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms