Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CTNNBIP1Q9NSA3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms