Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNX15Q9NRS6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms