Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPHK2Q9NRA0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPHK2Q9NRA0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms