Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FANCFQ9NPI8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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