Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LIN28AQ9H9Z2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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