Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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