Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ROPN1BQ9BZX4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms