Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM8Q9BZR9 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms