Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRIM54Q9BYV2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRIM54Q9BYV2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms